江户川柯南与少年侦探团卷入一起离奇密室杀人案，现场线索直指多年前的未解悬案。随着调查深入，柯南发现凶手与神秘组织“黑影”存在千丝万缕的联系。小兰与毛利小五郎也相继遇险，危机四伏。柯南利用阿笠博士发明的追踪眼镜和麻醉针，层层推理，最终在杯户大厦天台与真凶对峙，揭露其犯罪动机与组织阴谋。一场智力与勇气的较量，真相只有一个！