在联合军溃败后，地球迎来短暂和平。然而，时空裂缝突然出现，吞噬城市并释放出平行世界的怪物。戈登·弗里曼博士被紧急召回，他与前同事阿莱克斯·凡斯、伊莱·凡斯联手调查。他们发现裂缝源于黑山基地深处的一个失控实验，连接着多个濒临毁灭的平行维度。为阻止混沌蔓延，戈登必须穿越裂缝，关闭核心。在冒险中，他遭遇了镜像世界的邪恶版自己，并被迫做出艰难选择。最终，戈登牺牲自己，引爆引力脉冲，摧毁了所有裂缝，但也被困在虚空之中。留下悬念：他是否还能归来？