在宁静的森林里，啄木鸟侦探所接到一起离奇案件：河狸先生筑的堤坝一夜之间出现神秘大洞，导致下游水灾。啄木鸟侦探波波与助手松鼠奇奇展开调查，发现现场留有奇怪的啄痕和脚印。经过层层推理，他们锁定嫌犯是爱吃树根的穿山甲，但穿山甲却声称自己被冤枉。波波利用啄木鸟的独特听力，听出堤坝内藏有异常响声，最终揭开了真相——原来是一只狡猾的狐狸为了抓鱼而故意破坏堤坝。案件破获后，森林恢复了平静，啄木鸟侦探所的名声更加响亮。